普教所成立于1982年，现设有11个机构：上海市教育信息调查队（上海市教育委员会直接领导）、“国际学生评估项目（PISA）”上海项目研究中心和秘书处、教师发展研究中心、家庭教育研究与指导中心、教育政策研究室、教育心理研究室、课程教学研究室、学前教育研究室、普及指导室、《上海教育科研》杂志社、行政办公室。上海市中小学心理辅导协会挂靠在普教所。

现在编人员32人，其中正研究员1人，特级教师3人，副高级职称14人，中级职称及以下14人；现有博士9人、硕士12人；还聘有多名兼职研究人员。

普教所办所宗旨为：“理论与实践相结合、普及与提高相结合”，办所方向是“为教育宏观决策服务、为学校教育改革服务、为全国教育事业发展服务”。

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