2009年，上海市教育科学研究院对台湾地区教育交流工作，在认真总结自1997年以来的对台教育交流工作经验的基础上，在国台办的亲切关怀下，在市台办、市教委的直接指导和支持下， 以打造平台、提升水平、拓展领域为重点，通过组建上海市台湾教育研究中心、举办海峡两岸高职教育高峰论坛等创新举措，促进我院对台教育交流与合作工作创造新局面、迈上新台阶。

我院台湾教育研究中心的工作主要集中在两个方面：一是整理12年来我院与台湾教育交流积累的资料，建立台湾教育研究资料库。二是根据国台办、市台办的教育，立项研究“大陆高校面向台湾地区招生与大陆学生赴台湾地区高校就学的相关问题与对策研究”、“推进两岸高校合作办学与交流的政策研究”，以针对形势与任务的要求，为政府和高校提供相关政策与对策咨询。

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